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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6f4jA_ | 1.42 | PDB header: splicing | Chain: A: PDB Molecule: probable u2 small nuclear ribonucleoprotein a'; |
Added to library: Sat Jun 23 08:52:04 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | K | L | T | P | E | L | I | N | Q | S | M | Q | Y | I | N | P | V | R | E | R | E | L | D | L | R | G | Y | K | I | P | Q | I | E | N | L | G | A | T | L | D | Q | F | D | T | I | D | L | S | D | N | D | L | R | K | L | D | N | L | P | H | L | P | R | L | K | T | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | N | N | R | I | L | R | I | S | E | G | L | E | E | A | V | P | N | L | G | S | I | I | L | T | G | N | N | L | Q | E | L | S | D | L | E | P | L | V | G | F | T | K | L | E | T | I | S | L | L | I | N | P | V | S | T | K | P | N | Y | R | E | Y | M | A | Y | K | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | |
Sequence | Q | L | R | L | L | D | F | R | K | I | K | Q | K | D | R | Q | A | A | Q | E | F | F | R | T | K | Q | G | K | D | V | L | K | E | I | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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