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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6emlr_ | 3.60 | PDB header: ribosome | Chain: R: PDB Molecule: 40s ribosomal protein s2; |
Added to library: Sat Dec 2 08:40:13 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | L | D | T | S | H | M | R | Y | L | T | T | D | D | F | R | V | L | Q | A | V | E | Q | G | S | R | S | H | E | V | V | P | T | P | L | I | H | Q | I | S | Q | S | G | T | N | R | A | I | S | D | L | A | K | L | S | L | I | S | K | M | R | N | V | K | Y | D | G | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | S | B | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | Y | N | G | I | D | Y | L | A | L | K | T | M | L | N | R | D | T | V | Y | S | V | G | N | T | I | G | V | G | K | E | S | D | I | Y | K | V | S | D | K | N | G | N | P | R | V | M | K | I | H | R | L | G | R | T | Y | L | K | K | S | N | Q | G | A | N | W | M | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | R | L | A | A | N | K | E | Y | Q | F | M | S | M | L | Y | S | K | G | F | K | V | P | E | P | F | D | N | S | R | H | I | V | V | M | E | L | I | E | G | Y | P | M | R | R | L | R | K | H | K | N | I | P | K | L | Y | S | D | L | M | C | F | I | V | D | L | A | N | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | B | S | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . |
Sequence | L | I | H | C | D | F | N | E | F | N | I | M | I | K | F | V | V | I | D | F | P | Q | C | I | S | I | Q | H | Q | D | A | D | Y | Y | F | Q | R | D | V | D | C | I | R | R | F | F | K | K | K | L | K | Y | E | P | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | B | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T |
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