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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6eluJ_ | 2.30 | PDB header: antitoxin | Chain: J: PDB Molecule: serum resistance associated; vsg protein; |
Added to library: Sat Jan 27 08:25:54 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | N | L | A | D | V | A | G | I | A | L | A | K | I | N | N | L | I | K | Q | V | S | A | A | T | E | A | E | A | R | M | T | L | A | A | A | S | T | D | H | S | N | I | S | A | L | Y | A | A | A | S | N | I | V | T | R | C | V | L | N | A | V | H | A | L | T | S | L | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | A | L | T | A | A | T | N | T | V | A | I | R | Q | L | Y | N | K | I | G | D | L | E | K | Q | T | T | N | N | C | G | T | S | V | T | E | V | L | E | H | I | L | K | Q | E | A | L | K | E | A | L | L | S | I | V | K | K | P | K | G | A | P | D | K | T | A | A | D | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | T | A | L | I | N | G | V | V | P | N | S | T | A | Q | T | Q | K | L | K | E | K | I | L | N | T | L | V | P | K | L | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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