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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ds5D_ | 3.80 | PDB header: lipid binding protein | Chain: D: PDB Molecule: seipin; |
Added to library: Sat Oct 27 08:28:34 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | S | H | L | S | P | V | H | F | Y | Y | R | T | D | C | D | S | S | T | T | S | L | C | S | F | P | V | A | N | V | S | L | T | K | G | G | R | D | R | V | L | M | Y | G | Q | P | Y | R | V | T | L | E | L | E | L | P | E | S | P | V | N | Q | D | L | G | M | F | L | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | C | Y | T | R | G | G | R | I | I | S | T | S | S | R | S | V | M | L | H | Y | R | S | D | L | L | Q | M | L | D | T | L | V | F | S | S | L | L | L | F | G | F | A | E | Q | K | Q | L | L | E | V | E | L | Y | A | D | Y | R | E | N | S | Y | V | P | T | T | G | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | E | I | H | S | K | R | I | Q | L | Y | G | A | Y | L | R | I | H | A | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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