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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6d5fF_ | 3.70 | PDB header: virus | Chain: F: PDB Molecule: fimbrial protein; |
Added to library: Sat Sep 1 08:30:52 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | A | R | K | R | T | S | K | N | D | P | L | R | M | Y | L | N | Y | V | R | K | L | Q | T | M | G | D | A | Y | D | E | S | A | K | Y | R | I | A | N | F | E | N | G | F | K | S | L | H | M | V | E | N | E | F | K | Q | Y | L | A | N | V | I | D | E | A | I | K | S | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | P | Q | D | L | P | Y | V | N | E | I | K | L | A | L | M | K | I | F | T | S | W | L | K | Y | S | N | E | K | L | G | A | N | E | I | A | I | N | V | A | G | T | A | T | M | T | L | T | E | N | L | Y | G | T | R | V | S | C | E | E | A | V | S | L | I | N | S | I | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | |||
Sequence | V | W | V | G | V | E | P | F | E | A | E | E | R | E | G | A | C | L | V | T | P | R | S | P | L | P | P | V | P | I | S | S | P | T | G | F | S | A | P | I | Q | E | V | L | Q | A | K | S | P | E | E | I | I | G | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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