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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6cgaC_ | 3.50 | PDB header: hydrolase | Chain: C: PDB Molecule: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase calypso; |
Added to library: Sat Oct 6 08:31:46 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | L | E | L | E | S | D | P | G | L | F | T | L | L | L | K | D | F | G | C | H | D | V | Q | V | E | E | V | Y | D | L | Q | K | P | I | E | S | P | Y | G | F | I | F | L | F | R | W | I | F | V | K | A | I | S | S | I | F | F | A | Q | Q | V | V | P | N | S | C | A | T | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | L | S | V | L | L | N | C | N | E | N | N | L | Q | L | G | D | T | L | S | R | L | K | T | H | T | K | G | M | S | P | E | N | K | G | L | A | I | G | N | T | P | E | L | A | C | A | H | N | S | H | A | M | P | Q | A | R | R | R | E | A | F | H | F | V | S | F | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | N | G | Q | L | F | E | L | D | G | L | K | P | Y | P | M | N | H | G | G | W | E | D | S | W | T | D | K | F | R | R | V | M | A | E | R | L | G | D | I | R | F | N | L | M | A | V | V | P | D | R | R | I | A | I | T | H | K | L | K | M | L | R | T | N | Q | A | I | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | T | L | Q | K | L | L | T | A | R | D | L | Q | S | L | L | K | N | L | D | T | E | I | A | I | N | E | Q | H | L | A | D | E | N | D | R | R | H | M | F | K | V | D | A | S | R | R | T | H | N | Y | D | K | F | I | C | T | F | L | S | M | L | A | H | Q | G | V | L | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | V | S | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
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