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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6br8B_ | 2.30 | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: protein a6 homolog; |
Added to library: Sat Jun 23 08:20:39 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | K | K | D | T | N | E | I | V | Q | D | L | K | K | I | L | G | I | V | S | L | I | K | S | A | N | N | E | H | Q | A | Y | K | I | L | X | E | N | N | S | F | I | I | R | T | I | N | K | V | L | A | D | S | N | Y | I | I | K | I | I | A | L | F | N | T | D | V | V | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | I | K | L | E | E | Y | K | D | V | F | S | F | S | K | E | N | V | I | F | G | I | K | C | F | C | D | I | T | I | D | G | I | D | Q | I | N | N | K | Y | V | S | F | F | K | K | V | L | P | N | I | I | L | F | Q | T | S | C | V | K | T | T | Q | F | V | N | I | F | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | S | S | I | V | Y | S | E | I | L | T | N | E | R | L | H | V | L | F | S | E | I | X | A | S | F | K | T | K | V | S | V | E | D | L | K | K | R | K | V | N | N | I | Q | G | L | I | S | E | I | S | N | N | R | E | X | Y | K | N | I | F | V | E | E | Y | E | K | H | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | L | I | S | I | V | Q | C | I | T | D | N | Y | N | I | N | Y | K | E | N | A | V | D | I | E | F | I | F | D | F | I | Q | E | H | Y | I | S | K | L | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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