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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6bmaA_ | 1.98 | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: indole-3-glycerol phosphate synthase; |
Added to library: Sat Dec 2 08:20:27 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | M | I | L | D | K | I | F | E | K | T | K | E | D | L | K | E | R | K | L | K | L | P | Y | D | M | L | G | R | S | L | A | S | N | P | F | F | P | K | D | V | I | K | A | L | K | R | V | E | K | E | V | K | I | I | A | E | V | K | K | A | S | P | S | K | G | V | I | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | F | D | P | L | S | I | A | L | N | Y | E | K | N | K | A | A | A | I | S | V | L | T | E | P | H | F | F | K | G | S | L | E | Y | L | S | L | I | R | R | Y | T | Q | I | P | L | L | R | K | D | F | I | F | D | E | Y | Q | I | L | E | A | L | V | Y | G | A | D | F | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | I | A | K | M | L | S | M | K | E | L | K | K | L | L | E | F | A | R | H | L | G | L | E | A | L | V | E | I | H | D | K | E | D | L | S | K | A | I | F | A | G | A | D | I | I | G | I | N | H | R | N | L | E | D | F | T | M | D | M | S | L | C | E | K | L | I | P | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | T | S | B | T | T | T | B | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | P | N | S | K | I | I | I | A | E | S | G | L | E | N | K | E | F | L | E | H | L | Q | N | L | G | V | D | A | F | L | I | G | E | Y | F | M | R | E | K | D | E | G | K | A | L | K | A | L | L | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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