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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6b5cA_ | 2.40 | PDB header: cell cycle | Chain: A: PDB Molecule: katanin p60 atpase-containing subunit a-like 1; |
Added to library: Sat May 26 09:10:07 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | G | Y | D | K | D | L | V | E | A | L | E | R | D | I | V | S | R | N | P | S | I | H | W | D | D | I | A | D | L | E | E | A | K | K | L | L | R | E | A | V | V | L | P | M | W | M | P | D | F | F | K | G | I | R | R | P | W | K | G | V | L | M | V | G | P | P | G | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | T | M | L | A | K | A | V | A | T | E | C | G | T | T | F | F | N | V | S | S | S | T | L | T | S | K | S | E | K | L | V | R | L | L | F | E | M | A | R | F | Y | A | P | T | T | I | F | I | D | Q | I | D | S | I | C | S | R | T | S | D | E | H | E | A | S | R | R | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | E | L | L | I | Q | M | D | G | V | P | S | K | M | V | M | V | L | A | A | T | N | F | P | W | D | I | D | E | A | L | R | R | R | L | E | K | R | I | Y | I | P | L | P | T | A | K | G | R | A | E | L | L | K | I | N | L | R | E | V | E | L | D | P | D | I | Q | L | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | A | E | K | I | E | G | Y | S | G | A | D | I | T | N | V | C | R | D | A | S | L | M | A | M | R | R | R | I | N | G | L | S | P | E | E | I | R | A | L | S | K | E | E | L | Q | M | P | V | T | K | G | D | F | E | L | A | L | K | K | I | A | K | S | V | S | A | A | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | K | Y | E | K | W | M | V | E | F | G | S | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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