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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6b0bE_ | 3.28 | PDB header: hydrolase/rna | Chain: E: PDB Molecule: apobec3h; |
Added to library: Sat Oct 28 08:32:18 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | T | A | E | T | F | R | L | Q | F | N | N | K | R | R | L | R | R | P | Y | Y | P | R | K | A | L | L | C | Y | Q | L | T | P | Q | N | G | S | T | P | T | R | G | Y | F | E | N | K | K | E | C | H | A | E | I | C | F | I | N | E | I | K | S | M | G | L | D | E | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | B | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | Y | Q | V | T | C | Y | L | T | W | S | P | C | S | S | C | A | W | E | L | V | D | F | I | K | A | H | D | H | L | N | L | R | I | F | A | S | R | L | Y | Y | H | W | C | K | P | Q | Q | D | G | L | R | L | L | C | G | S | Q | V | P | V | E | V | M | G | F | P | E | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||
Sequence | D | C | W | E | N | F | V | D | H | E | K | P | L | S | F | N | P | Y | K | M | L | E | E | L | D | K | N | S | R | A | I | K | R | R | L | D | R | I | K | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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