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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6b07B_ | 1.98 | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: B: PDB Molecule: farnesyl diphosphate synthase; |
Added to library: Sat Dec 16 08:30:49 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | K | E | S | F | E | D | V | L | P | S | I | L | N | T | I | T | T | N | S | E | L | T | E | V | P | E | V | A | N | W | L | K | K | V | L | E | Y | N | L | A | G | G | K | K | A | R | G | L | T | T | L | F | A | Y | E | M | L | E | K | P | E | N | I | T | E | E | T | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | K | T | L | G | W | C | V | E | I | L | Q | G | F | L | V | M | L | D | D | I | M | D | G | S | T | T | R | R | G | V | P | C | W | Y | Q | L | P | E | V | G | L | A | A | V | N | D | S | S | L | M | F | S | S | I | F | Y | V | L | H | A | H | F | A | D | K | K | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | N | L | V | E | L | F | N | E | S | L | M | H | T | S | I | G | Q | H | L | D | V | T | M | R | Q | K | S | D | Y | S | L | F | T | I | E | R | Y | N | A | I | V | K | Y | K | T | A | Y | Y | T | Y | Q | L | P | V | C | L | G | M | L | L | A | N | I | S | D | P | V | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | K | A | E | D | M | C | L | E | I | G | K | F | F | Q | I | Q | D | D | Y | I | D | C | Y | G | D | E | S | L | T | G | K | M | G | T | D | I | Q | E | A | K | C | S | W | L | A | V | M | A | L | Q | R | C | S | A | S | Q | K | I | V | F | T | T | C | Y | G | S | K | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | A | H | I | E | R | I | K | E | L | Y | K | Q | L | Q | L | P | E | L | Y | A | Q | E | E | T | R | M | Y | E | S | L | I | K | Q | A | H | G | L | P | S | E | L | S | P | A | L | F | V | R | L | I | H | M | I | Y | K | R | N | H | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | T | T |
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