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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6agfB_ | 3.20 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: sodium channel subunit beta-1; |
Added to library: Sat Oct 13 08:31:42 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | C | V | E | V | D | S | E | T | E | A | V | Y | G | M | T | F | K | I | L | C | I | S | C | K | R | R | S | E | T | N | A | E | T | F | T | E | W | T | F | R | Q | K | G | T | E | E | F | V | K | I | L | R | Y | E | N | E | V | L | Q | L | E | E | D | E | R | F | E | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | W | N | G | S | R | G | T | K | D | L | Q | D | L | S | I | F | I | T | N | V | T | Y | N | H | S | G | D | Y | E | C | H | V | Y | R | L | L | F | F | E | N | Y | E | H | N | T | S | V | V | K | K | I | H | I | E | V | V | D | K | A | N | R | D | M | A | S | I | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | E | I | M | M | Y | V | L | I | V | V | L | T | I | W | L | V | A | E | M | I | Y | C | Y | K | K | I | A | A | A | T | E | T | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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