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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6a42A_ | 1.70 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: rna-directed dna polymerase homolog (r1),polyubiquitin-c; |
Added to library: Sat Oct 27 08:40:44 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | D | I | R | P | R | L | R | I | G | Q | I | N | L | G | G | A | E | D | A | T | R | E | L | P | S | I | A | R | D | L | G | L | D | I | V | L | V | Q | A | Q | Y | S | M | V | G | F | L | A | Q | C | G | A | H | P | K | A | G | V | Y | I | R | N | R | V | L | P | C | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | H | H | L | S | S | T | H | I | T | V | V | H | I | G | G | W | D | L | Y | M | V | S | A | Y | F | Q | Y | S | D | P | I | D | P | Y | L | H | R | L | G | N | I | L | D | R | L | R | G | A | R | V | V | I | C | A | D | T | N | A | H | S | P | L | W | H | S | L | P | R | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | V | G | R | G | Q | E | V | A | D | R | R | A | K | M | E | D | F | I | G | A | R | R | L | V | V | H | N | A | D | G | H | L | P | T | F | S | T | A | N | G | E | S | Y | V | D | V | T | L | S | T | R | G | V | R | V | S | E | W | R | V | T | N | E | S | S | S | D | H | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | I | V | F | G | V | G | G | G | G | S | M | Q | I | F | V | K | T | L | T | G | K | T | I | T | L | E | V | E | P | S | D | T | I | E | N | V | K | A | K | I | Q | D | K | E | G | I | P | P | D | Q | Q | R | L | I | F | A | G | K | Q | L | E | D | G | R | T | L | S | D | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | B | S | G | G | G | T | T | T | T | S | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | I | Q | K | E | S | T | L | H | L | V | L | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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