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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ztcA_ | 1.70 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: lmo2088 protein; |
Added to library: Sat Jun 15 11:02:02 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | K | E | E | I | K | Q | A | A | L | T | L | F | A | N | N | G | F | E | G | T | S | L | A | D | I | A | G | V | V | G | L | K | K | Q | S | I | Y | S | H | F | K | D | K | D | D | L | F | L | S | I | M | K | D | A | K | S | T | E | I | D | Y | Y | R | A | K | L | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | D | L | S | R | P | D | L | V | L | S | S | L | L | F | G | V | K | E | L | Y | D | T | D | E | A | Y | Q | F | W | L | R | Y | G | F | Y | P | P | K | H | L | Y | E | V | V | Q | A | D | I | T | E | N | V | L | Q | M | E | H | E | F | T | D | L | F | S | N | W | M | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | ||||
Sequence | K | L | I | P | M | Q | D | V | E | T | M | K | E | A | Y | M | G | I | L | D | A | V | I | V | D | I | V | Y | V | N | D | P | E | R | T | E | K | K | I | T | A | L | W | Q | I | F | W | R | G | I | T | L | K | A | L | N | L | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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