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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5z9xA_ | 2.80 | PDB header: plant protein/rna | Chain: A: PDB Molecule: small rna degrading nuclease 1; |
Added to library: Sat Jun 30 08:23:53 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | K | L | A | T | A | E | K | Q | V | L | D | E | L | V | K | L | L | Q | S | R | D | L | R | G | E | N | G | N | W | K | E | F | L | H | V | Y | D | K | N | A | D | S | P | S | D | P | S | R | R | S | H | E | D | L | V | Q | F | L | T | T | F | K | K | K | E | D | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | K | C | H | A | N | H | L | L | I | E | N | L | K | Q | E | S | Q | D | E | D | T | P | E | Q | M | L | V | R | L | T | V | E | H | P | S | Y | S | L | D | Y | S | F | K | P | Y | S | E | D | W | F | V | S | D | V | G | M | K | M | K | K | V | M | E | S | T | N | M | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | D | C | E | M | V | L | C | E | D | G | T | E | G | L | V | R | V | G | V | V | D | R | D | L | K | V | I | L | D | E | F | V | K | P | N | K | P | V | V | D | Y | R | T | D | I | T | G | I | T | A | E | D | I | E | N | A | S | L | S | V | V | D | I | Q | E | T | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | S | B | S | S | B | S | T | T | S | S | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | F | L | S | T | G | T | I | L | V | G | H | S | L | N | R | D | L | E | V | L | K | I | D | H | P | K | V | I | D | T | A | L | V | F | K | L | R | R | P | S | L | N | N | L | C | K | S | I | L | G | Y | G | V | P | H | D | C | V | H | D | A | S | A | A | M | K | L | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | V | E | K | R | V | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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