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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ymxB_ | 1.35 | PDB header: signaling protein, hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: mutual gliding-motility protein mgla; |
Added to library: Sat Oct 27 09:55:02 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | F | I | N | Y | S | S | R | E | I | N | C | K | I | V | Y | Y | G | P | G | L | C | G | K | T | T | N | L | Q | Y | I | Y | N | K | T | A | A | E | T | K | G | K | L | I | S | L | S | T | E | T | D | R | T | L | F | F | D | F | L | P | L | F | K | T | R | F | H | L | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | G | Q | V | F | Y | D | A | S | R | K | L | I | L | K | G | V | D | G | V | V | F | V | A | D | S | Q | I | E | R | M | E | A | N | M | E | S | L | E | N | L | R | I | N | L | A | E | Q | G | Y | D | L | N | K | I | P | Y | V | I | Q | Y | N | K | R | D | L | P | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . |
Sequence | V | T | V | E | E | M | R | K | A | L | N | H | R | N | I | P | E | Y | Q | A | V | A | P | T | G | V | G | V | F | D | T | L | K | A | V | A | K | L | V | L | T | E | L | K | K | G | G | G | S | H | H | H | H | H | H | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | G | G | G | T | B | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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