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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ykjA_ | 1.53 | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: peroxiredoxin prx1, mitochondrial; |
Added to library: Sat Oct 27 08:27:56 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | L | R | I | N | S | D | A | P | N | F | D | A | D | T | T | V | G | K | I | N | F | Y | D | Y | L | G | D | S | W | G | V | L | F | S | H | P | A | D | F | T | P | V | T | T | E | V | S | A | F | A | K | L | K | P | E | F | D | K | R | N | V | K | L | I | G | L | S | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | E | S | H | E | K | W | I | Q | D | I | K | E | I | A | K | V | K | N | V | G | F | P | I | I | G | D | T | F | R | N | V | A | F | L | Y | D | M | V | D | A | E | G | F | K | N | I | N | D | G | S | L | K | T | V | R | S | V | F | V | I | D | P | K | K | K | I | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | F | T | Y | P | S | T | V | G | R | N | T | S | E | V | L | R | V | I | D | A | L | Q | L | T | D | K | E | G | V | V | T | P | I | N | W | Q | P | A | D | D | V | I | I | P | P | S | V | S | N | D | E | A | K | A | K | F | G | Q | F | N | E | I | K | P | Y | L | R | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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