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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5yhoA_ | 2.40 | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: alpha-acetolactate decarboxylase; |
Added to library: Sat Oct 13 08:34:49 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Q | H | P | D | S | V | I | Y | Q | T | S | L | M | S | A | L | L | S | G | V | Y | E | G | E | T | T | I | A | D | L | L | A | H | G | D | F | G | L | G | T | F | N | E | L | D | G | E | M | I | A | F | S | S | Q | V | Y | Q | L | R | A | D | G | S | A | R | A | A | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | Q | K | T | P | F | A | V | M | T | W | F | Q | P | Q | Y | R | K | T | F | D | T | P | V | S | R | Q | Q | I | H | D | V | I | D | Q | Q | I | P | S | D | N | L | F | C | A | L | R | I | D | G | N | F | R | H | A | H | T | R | T | V | P | R | Q | T | P | P | Y | R | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | D | V | L | D | D | Q | P | V | F | R | F | N | Q | R | E | G | V | L | V | G | F | R | T | P | Q | H | M | Q | G | I | N | V | A | G | Y | H | E | H | F | I | T | D | D | R | Q | G | G | G | H | L | L | D | Y | Q | L | E | S | G | V | L | T | F | G | E | I | H | K | L | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | B | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | D | L | P | A | D | S | A | F | L | Q | A | N | L | H | P | S | N | L | D | A | A | I | R | S | V | E | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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