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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5yduA_ | 2.65 | PDB header: ribosomal protein | Chain: A: PDB Molecule: ribosome biogenesis protein utp30; |
Added to library: Sat Nov 4 08:23:07 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | A | E | K | A | L | K | A | L | I | L | Q | C | E | E | N | P | S | L | K | N | D | K | D | I | H | I | I | I | N | T | G | K | K | M | G | I | N | R | D | N | I | P | R | I | I | P | L | T | K | Y | K | L | F | K | P | R | D | L | N | I | L | L | I | T | K | D | P | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | Y | R | E | T | L | T | K | D | E | H | T | S | E | L | F | K | E | I | I | S | V | K | N | L | R | R | R | F | Q | L | Y | K | D | F | D | L | V | V | A | D | Y | R | V | H | H | L | L | P | Y | H | G | S | K | K | L | P | Y | M | I | R | M | S | K | E | V | K | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | Q | Q | M | V | E | K | C | D | P | I | Y | V | R | A | Q | L | R | S | I | C | K | N | T | S | Y | I | P | N | N | D | N | C | L | S | V | R | V | G | Y | I | Q | K | H | S | I | P | E | I | L | Q | N | I | Q | D | T | I | N | F | L | T | D | K | S | K | R | P | Q | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | T | T | B | T | G | G | G | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | I | K | G | G | I | I | S | I | F | V | K | T | S | N | S | T | S | L | P | I | Y | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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