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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5xsdA_ | 2.50 | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: periplasmic binding protein/laci transcriptional regulator; |
Added to library: Sat Aug 5 09:33:09 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | P | K | I | V | L | I | S | H | I | K | T | N | P | Y | W | L | D | I | K | A | G | A | E | R | A | A | K | E | R | G | A | V | V | E | F | L | V | S | G | I | I | T | Y | V | Y | K | K | K | I | N | S | A | M | E | K | G | I | P | V | V | T | I | A | S | D | E | E | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | R | I | A | Y | V | G | T | D | N | V | L | A | G | Q | V | A | G | K | E | M | V | K | Q | I | G | T | S | G | N | V | A | I | V | M | G | G | K | N | V | K | N | Q | K | E | R | V | E | G | F | T | Q | Y | I | K | S | N | S | N | L | K | I | V | D | T | D | S | S | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | L | L | E | A | E | I | I | T | R | K | I | L | N | R | N | D | N | I | N | A | L | F | C | T | S | A | L | D | G | I | G | A | A | R | A | V | K | D | L | N | Y | K | D | R | V | K | I | I | C | F | D | D | L | D | D | T | L | S | N | I | R | N | G | L | V | S | A | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | B | T | T | B | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | ||||||||||
Sequence | V | Q | K | S | N | E | M | G | Y | R | A | V | N | I | I | M | D | K | I | E | G | K | S | N | K | K | S | L | I | D | V | N | V | I | N | K | S | D | V | D | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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