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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5xqlA_ | 2.49 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: multidrug-efflux transporter 1 regulator; |
Added to library: Sat Jul 1 08:44:17 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | L | T | I | G | Q | L | A | R | I | F | E | I | S | T | K | T | L | R | H | Y | D | A | I | G | L | F | V | P | A | R | T | G | S | D | N | G | Y | R | Y | Y | Q | P | E | Q | I | E | Q | L | S | R | I | L | A | L | R | R | L | D | V | P | L | E | A | I | D | R | L | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | G | A | L | D | D | P | Q | R | L | R | H | F | L | Q | R | H | Q | H | T | L | R | E | E | I | S | A | R | Q | R | L | L | A | E | L | D | R | T | L | A | T | L | A | H | W | R | I | R | N | M | H | A | R | I | V | E | R | P | A | F | S | V | V | G | M | E | Y | F | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | P | T | I | G | Q | L | W | E | R | F | I | P | R | E | H | E | I | A | G | K | H | D | P | E | V | S | Y | G | I | C | A | Q | Q | P | N | G | E | F | H | Y | V | A | G | F | E | V | Q | E | G | W | P | V | P | E | G | M | V | R | F | Q | V | P | A | Q | K | Y | A | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | B | S | T | T | T | T | S | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | H | K | G | T | A | P | Q | I | A | E | S | F | Q | A | I | Y | S | H | L | L | A | E | R | G | L | E | P | K | A | G | V | D | F | E | Y | Y | D | Q | R | F | R | G | P | L | D | P | N | S | Q | V | D | L | Y | I | P | I | Y | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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