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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5xpwA_ | 2.00 | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: amphioxus igvj-c2; |
Added to library: Sat Apr 21 09:14:50 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | S | H | Q | Q | G | Q | S | H | L | F | E | C | D | Y | P | I | S | A | D | T | Y | V | I | N | W | Y | K | D | G | T | S | V | M | N | Y | L | S | G | G | E | P | A | F | T | E | D | L | D | D | R | T | D | V | Q | F | V | N | N | R | N | L | E | I | T | N | L | R | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | E | G | E | Y | Y | C | S | V | I | E | I | G | A | G | G | Q | S | G | D | G | T | R | Y | Q | L | V | V | F | V | P | P | T | I | T | L | M | G | G | P | Y | E | V | E | V | G | E | M | M | M | S | T | C | R | A | N | S | H | P | P | S | N | F | T | W | T | L | P | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | T | T | S | B | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||
Sequence | N | V | T | Q | G | A | V | L | E | I | T | N | M | T | Q | A | E | I | G | T | Y | M | C | T | A | D | N | G | Y | G | T | D | Y | E | S | V | D | I | T | M | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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