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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5xk9F_ | 2.14 | PDB header: transferase | Chain: F: PDB Molecule: undecaprenyl diphosphate synthase; |
Added to library: Sat Jan 13 08:18:17 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | M | T | N | L | M | L | L | P | D | G | M | R | R | W | S | Q | K | Q | G | I | S | L | D | D | S | Y | A | A | M | T | D | K | L | V | E | F | T | G | W | A | R | E | E | G | F | T | T | F | Y | V | T | V | S | S | V | A | N | Y | S | R | S | E | E | Q | V | T | T | A | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | T | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | A | F | T | E | V | V | R | R | C | H | D | T | L | N | F | N | Y | S | G | T | L | E | V | V | P | E | R | W | L | T | E | L | E | A | L | R | A | K | S | D | S | Q | S | D | F | T | L | H | F | I | M | G | M | S | L | A | H | E | V | I | G | I | F | N | K | F | N | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | P | A | L | T | E | E | L | L | A | A | N | A | Y | V | P | E | P | V | D | F | L | I | R | P | G | G | H | V | R | M | S | S | F | Y | P | L | M | S | P | F | A | E | M | Y | F | C | P | T | L | L | N | D | M | T | R | A | D | F | D | V | A | L | E | D | L | R | E | R | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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