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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5wtlB_ | 2.30 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: ompa family protein; |
Added to library: Sat Dec 16 08:49:56 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | T | D | K | D | G | I | P | D | N | K | D | A | C | P | E | V | P | G | L | K | E | F | N | G | C | P | D | T | D | G | D | G | I | P | D | K | D | D | A | C | P | Q | V | K | G | P | K | E | F | N | G | C | P | D | T | D | G | D | G | I | P | D | K | D | D | A | C | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | B | G | G | G | T | T | B | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | A | G | P | K | E | F | N | G | C | P | D | T | D | G | D | G | I | P | D | K | D | D | K | C | P | D | V | A | G | P | A | E | N | G | G | C | P | W | P | D | T | D | G | D | G | V | L | D | K | D | D | L | C | P | E | V | A | G | P | A | S | N | K | G | C | P | E | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | E | Q | K | Q | L | N | Q | Y | A | K | T | I | L | F | D | T | G | K | A | T | I | K | F | Q | S | A | E | V | L | N | Q | I | I | N | V | L | K | K | Y | P | N | S | R | F | R | I | E | G | H | T | D | S | T | G | K | K | A | K | N | M | I | L | S | Q | N | R | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | B | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | A | V | K | V | Y | L | I | Q | G | G | I | D | A | G | R | L | E | S | Q | G | F | G | P | E | K | P | I | A | S | N | K | N | K | K | G | R | E | L | N | R | R | V | E | I | N | L | I | K | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | S |
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