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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5w53B_ | 1.71 | PDB header: cell invasion | Chain: B: PDB Molecule: reticulocyte binding protein 2, putative; |
Added to library: Sat Dec 2 08:17:03 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | T | N | T | T | D | N | I | D | Y | F | D | I | S | D | E | S | N | Y | Y | L | I | S | Q | L | R | P | H | F | S | N | I | Y | F | F | D | E | F | K | R | Y | A | S | Y | H | T | E | I | K | R | Y | E | D | I | H | K | T | K | V | N | S | L | L | N | E | A | S | R | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | I | C | N | R | A | K | N | T | V | K | G | L | I | N | I | L | E | N | P | Q | K | F | K | T | Q | R | E | S | Y | D | V | K | L | R | Q | Y | E | E | K | K | E | A | F | R | G | C | L | L | N | K | N | R | K | N | L | D | Q | I | K | K | I | N | N | E | I | R | D | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | L | K | C | S | Q | D | C | Q | T | N | V | Y | F | D | M | I | K | I | Y | L | V | D | F | K | K | M | P | Y | E | N | Y | D | T | F | I | K | Q | Y | K | N | S | Y | L | S | G | V | D | M | I | R | K | I | E | K | Q | I | D | N | P | V | T | I | N | A | I | K | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | K | E | M | G | Y | I | I | D | R | F | E | Y | H | L | Q | K | V | K | H | S | I | D | Q | V | T | A | L | S | D | G | V | K | P | K | Q | V | T | K | N | R | L | K | E | Y | Y | F | N | I | G | N | Y | Y | S | I | F | K | F | G | K | D | S | L | N | M | L | N | K | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | H | K | E | K | I | V | H | N | L | L | G | E | L | F | G | H | L | E | E | R | I | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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