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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vx6A_ | 3.20 | PDB header: gmp binding protein | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein ypfa; |
Added to library: Sat Nov 25 08:16:25 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | I | G | E | N | V | L | L | E | Y | I | E | E | N | E | L | K | K | A | K | S | K | A | V | S | I | E | N | N | E | L | L | I | A | Y | P | V | D | V | V | T | G | R | T | V | I | L | H | N | D | M | E | V | T | V | E | F | V | G | K | D | E | V | P | Y | R | F | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | I | K | G | K | V | K | D | K | L | Q | M | I | C | L | E | M | P | P | R | E | K | M | K | R | I | Q | R | R | Q | Y | V | R | T | D | A | V | L | D | V | Q | I | Q | P | E | E | E | I | R | T | L | S | Y | N | I | S | A | G | G | I | A | V | V | L | A | D | G | L | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | S | G | E | S | L | R | L | I | I | R | L | P | E | E | E | H | T | R | Q | I | E | T | E | A | V | V | R | R | I | F | N | D | P | K | S | E | K | R | K | M | T | L | E | Y | S | E | I | A | A | G | D | Q | Q | A | L | L | Q | Y | C | I | R | R | Q | L | N | K | R | R | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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