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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vtmX_ | 2.04 | PDB header: transport protein | Chain: X: PDB Molecule: type ii secretion system protein k; |
Added to library: Sat May 26 08:38:10 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | R | Q | A | W | H | Y | A | L | G | G | E | R | L | A | E | A | V | L | R | R | D | L | P | V | D | H | L | G | E | A | W | A | R | P | M | T | P | F | K | L | D | G | G | E | L | R | V | R | I | E | D | P | S | G | R | F | N | L | N | G | L | V | R | K | R | K | V | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | S | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | S | V | K | Q | F | R | R | L | L | A | T | L | G | M | K | E | E | I | V | Q | G | L | P | D | R | L | A | D | W | L | D | A | D | Q | N | P | Q | G | E | Q | G | A | E | D | N | Q | Y | L | L | E | A | P | A | Y | R | A | A | N | R | S | F | K | D | V | S | E | L | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | L | S | E | A | D | Y | R | R | L | L | P | F | V | S | A | L | P | E | D | A | P | L | N | V | N | T | A | S | V | P | V | L | A | A | X | F | E | I | D | P | G | Q | A | E | N | I | V | D | A | R | G | R | E | G | F | Q | S | K | D | D | F | T | K | H | L | T | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | G | N | V | S | Y | A | V | G | T | R | Y | F | Q | V | I | S | E | V | S | L | G | D | R | R | Q | V | L | V | S | T | L | Q | R | G | K | D | G | K | I | R | V | M | A | R | D | M | G | Q | G | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S |
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