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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5vq5B_ | 1.60 | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: adhesin; |
Added to library: Sat May 27 08:19:55 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | D | D | Y | V | P | S | Q | I | A | V | N | T | S | T | L | P | G | V | V | I | T | Y | P | R | V | I | G | E | L | A | G | T | S | N | Q | Y | V | F | N | G | G | A | I | A | L | X | R | G | K | F | T | P | A | L | P | K | I | G | S | I | T | Y | T | F | H | Q | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | D | S | S | D | F | D | I | Y | D | I | G | V | S | G | L | G | I | I | I | G | X | A | G | Y | W | P | A | T | P | L | V | P | I | N | S | S | G | I | Y | I | D | P | V | G | A | N | T | N | P | N | T | Y | N | G | A | T | A | S | F | G | A | R | L | F | V | A | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | B | S | S | S | G | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | T | G | R | L | P | N | G | Y | I | T | I | P | T | R | Q | L | G | T | I | L | L | E | A | K | R | T | S | L | N | N | K | G | L | T | A | P | V | X | L | N | G | G | R | I | Q | V | Q | S | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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