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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5v44A_ | 1.56 | PDB header: chaperone | Chain: A: PDB Molecule: sacsin; |
Added to library: Sat May 27 08:53:08 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | L | V | D | F | L | K | D | I | L | R | R | Y | P | E | G | G | Q | I | L | K | E | L | I | Q | N | A | E | D | A | G | A | T | E | V | K | F | L | Y | D | E | T | Q | Y | G | T | E | T | L | W | S | K | D | X | A | P | Y | Q | G | P | A | L | Y | V | Y | N | N | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | T | P | E | D | W | H | G | I | Q | G | I | G | F | N | S | V | Y | H | I | T | D | V | P | C | I | F | S | G | D | Q | I | G | X | L | D | P | H | Q | T | L | F | G | P | H | E | S | G | Q | C | W | N | L | K | D | D | S | K | E | I | S | E | L | S | D | Q | F | A | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | T | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | G | I | F | G | S | T | K | E | T | F | I | N | G | N | F | P | G | T | F | F | R | F | P | L | R | L | Q | P | S | Q | L | S | S | N | L | Y | N | K | Q | K | V | L | E | L | F | E | S | F | R | A | D | A | D | T | V | L | L | F | L | K | S | V | Q | D | V | S | L | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | E | A | D | G | T | E | K | L | V | F | R | V | T | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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