| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5v3yA_ | 1.98 | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: A: PDB Molecule: polyketide synthase pks13 (termination polyketide |
Added to library: Sat Jul 8 08:39:40 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | D | G | F | V | R | T | L | R | A | R | P | E | A | G | G | K | V | P | V | F | V | F | H | P | A | G | G | S | T | V | V | Y | E | P | L | L | G | R | L | P | A | D | T | P | M | Y | G | F | E | R | V | E | G | S | I | E | E | R | A | Q | Q | Y | V | P | K | L | I | E | M | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | D | G | P | Y | V | L | V | G | W | S | L | G | G | V | L | A | Y | A | C | A | I | G | L | R | R | L | G | K | D | V | R | F | V | G | L | I | D | A | V | R | A | G | E | E | I | P | Q | T | K | E | E | I | R | K | R | W | D | R | Y | A | A | F | A | E | K | T | F | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | I | P | A | I | P | Y | E | Q | L | E | E | L | D | D | E | G | Q | V | R | F | V | L | D | A | V | I | P | A | G | I | I | E | H | Q | R | T | S | Y | L | D | N | R | A | I | D | T | A | Q | I | Q | P | Y | D | G | H | V | T | L | Y | M | A | D | R | Y | H | D | D | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | B | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | M | F | E | P | R | Y | A | V | R | Q | P | D | G | G | W | G | E | Y | V | S | D | L | E | V | V | P | I | G | G | E | H | I | Q | A | I | D | E | P | I | I | A | K | V | G | E | H | M | S | R | A | L | G | Q | I | E | A | D | R | T | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S | B | G | G | G | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|