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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5uyvA_ | 1.69 | PDB header: metal transport | Chain: A: PDB Molecule: periplasmic chelated iron-binding protein yfea; |
Added to library: Sat Jul 15 08:34:43 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | A | K | K | F | K | V | V | T | T | F | T | I | I | Q | D | I | A | Q | N | I | A | G | D | V | A | V | V | E | S | I | T | K | P | G | A | E | I | H | D | Y | Q | P | T | P | R | D | I | V | K | A | Q | S | A | D | L | I | L | W | N | G | M | N | L | E | R | W | F | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | F | E | S | I | K | D | V | P | S | A | V | V | T | A | G | I | T | P | L | P | I | R | E | G | P | Y | S | G | I | A | N | P | H | A | W | M | S | P | S | N | A | L | I | Y | I | E | N | I | R | K | A | L | V | E | H | D | P | A | H | A | E | T | Y | N | R | N | A | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | S | B | S | G | G | G | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | A | E | K | I | K | A | L | D | A | P | L | R | E | R | L | S | R | I | P | A | E | Q | R | W | L | V | T | S | E | G | A | F | S | Y | L | A | K | D | Y | G | F | K | E | V | Y | L | W | P | I | N | A | E | Q | Q | G | I | P | Q | Q | V | R | H | V | I | D | I | I | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . |
Sequence | N | K | I | P | V | V | F | S | E | S | T | I | S | D | K | P | A | K | Q | V | S | K | E | T | G | A | Q | Y | G | G | V | L | Y | V | D | S | L | S | G | E | K | G | P | V | P | T | Y | I | S | L | I | N | M | T | V | D | T | I | A | K | G | F | G | Q | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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