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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5uvgA_ | 1.85 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: sphingomyelin phosphodiesterase 3,sphingomyelin |
Added to library: Sat Jul 1 08:29:03 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | K | S | F | C | F | A | T | A | N | V | C | L | L | P | D | S | L | A | R | V | N | N | L | F | N | T | Q | A | R | A | K | E | I | G | Q | R | I | R | N | G | A | A | R | P | Q | I | K | I | Y | I | D | S | P | H | P | D | E | A | F | D | H | E | V | S | A | F | F | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | D | F | L | C | L | Q | E | V | F | D | K | R | A | A | T | K | L | K | E | Q | L | H | G | Y | F | E | Y | I | L | Y | D | V | G | V | Y | G | C | L | N | S | G | L | L | F | A | S | R | Y | P | I | M | D | V | A | Y | H | C | Y | P | N | K | C | N | D | D | A | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | K | G | A | L | F | L | K | V | Q | V | G | S | T | P | Q | D | Q | R | I | V | G | Y | I | A | C | T | H | L | H | A | P | Q | E | D | S | A | I | R | C | G | Q | L | D | L | L | Q | D | W | L | A | D | F | R | K | S | T | S | S | P | E | E | L | V | A | F | D | V | V | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | D | F | N | F | D | N | C | S | S | D | D | K | L | E | Q | Q | H | S | L | F | T | H | Y | R | D | P | C | R | L | G | P | G | E | E | K | P | W | A | I | G | T | L | L | D | T | N | D | V | C | T | P | D | N | L | Q | K | V | L | E | S | E | E | G | R | R | E | Y | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | B | B | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | F | P | T | S | K | S | S | G | Q | K | G | R | K | E | L | L | K | G | N | G | R | R | I | D | Y | M | L | H | A | E | E | G | L | C | P | D | W | K | A | E | V | E | E | F | S | F | I | T | Q | L | S | G | L | T | D | H | L | P | V | A | M | R | L | M | V | S | S | G | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | B |
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