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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5umfB_ | 1.40 | PDB header: isomerase | Chain: B: PDB Molecule: ribulose-phosphate 3-epimerase; |
Added to library: Thu Feb 23 10:13:58 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | Y | R | I | A | P | S | I | L | S | A | D | F | A | R | L | G | E | E | V | A | N | V | I | A | A | G | A | D | L | I | H | F | D | V | M | D | N | H | Y | V | P | N | L | T | F | G | P | M | V | C | A | A | L | K | P | Y | A | S | V | P | I | D | V | H | L | M | V | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | B | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | D | L | I | Q | S | F | A | K | A | G | A | S | I | I | T | F | H | P | E | A | S | R | H | I | D | R | S | L | S | L | I | R | D | M | G | C | Q | A | G | L | V | L | N | P | A | T | P | V | Y | V | L | E | N | V | L | D | R | L | D | M | V | L | L | M | S | V | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | F | G | G | Q | S | F | I | P | H | T | L | E | K | I | R | Q | V | R | A | M | L | D | R | Y | E | G | K | S | G | R | R | I | A | I | E | V | D | G | G | I | K | T | D | N | I | A | A | V | A | R | A | G | A | D | T | F | V | A | G | S | A | I | F | G | K | P | D | Y | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | T | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | I | A | A | M | R | A | E | L | E | K | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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