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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5uk5A_ | 2.51 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: neurogenic locus notch homolog protein 1; |
Added to library: Tue Mar 14 10:42:31 2017 | |
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Sequence | E | C | Q | L | M | P | N | A | C | Q | N | G | G | T | C | H | N | S | H | G | G | Y | N | C | V | C | V | N | G | W | T | G | E | D | C | S | E | N | I | D | D | C | A | S | A | A | C | F | Q | G | A | T | C | H | D | R | V | A | S | F | Y | C | E | C | P | H | G | R | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | C | H | L | N | D | A | C | I | S | N | P | C | N | E | G | S | N | C | D | T | N | P | V | N | G | K | A | I | C | T | C | P | S | G | Y | T | G | P | A | C | S | Q | D | V | D | E | C | A | L | G | A | N | P | C | E | H | A | G | K | C | L | N | T | L | G | S | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . |
Sequence | C | Q | C | L | Q | G | Y | T | G | P | R | C | E | I | D | V | N | E | C | I | S | N | P | C | Q | N | D | A | T | C | L | D | Q | I | G | E | F | Q | C | I | C | M | P | G | Y | E | G | V | Y | C | E | S | G | R | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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