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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ujeA_ | 2.50 | PDB header: gene regulation | Chain: A: PDB Molecule: sbni protein; |
Added to library: Sat Jan 27 08:20:03 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | N | H | I | H | E | H | L | K | L | V | P | V | D | K | I | D | L | H | E | T | F | E | P | L | R | L | E | K | T | K | S | S | I | E | A | D | D | F | I | R | H | P | I | L | V | T | A | X | Q | H | G | R | Y | X | V | I | D | G | V | H | R | Y | T | S | L | K | A | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | B | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | K | K | V | P | V | Q | E | I | H | E | T | Q | Y | S | I | S | T | W | Q | H | K | V | P | F | G | V | W | W | E | T | L | Q | Q | E | H | R | L | P | W | T | T | E | T | R | Q | E | A | P | F | I | T | X | C | H | G | D | T | E | Q | Y | L | Y | T | K | D | L | G | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | F | Q | V | W | E | K | V | V | A | S | Y | S | G | C | C | S | V | E | R | I | A | Q | G | T | Y | P | C | L | S | Q | Q | D | V | L | X | K | Y | Q | P | L | S | Y | K | E | I | E | A | V | V | H | K | G | E | T | V | P | A | G | V | T | R | F | N | I | S | G | R | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | B | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | ||||||||||||||||||||
Sequence | N | L | Q | V | P | L | A | L | L | K | Q | D | D | D | V | E | Q | L | R | N | W | K | Q | F | L | A | D | K | F | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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