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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ujdB_ | 2.10 | PDB header: gene regulation | Chain: B: PDB Molecule: siderophore biosynthesis protein sbni; |
Added to library: Sat Jan 27 08:19:43 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | Q | I | Y | D | T | L | Q | L | I | P | V | D | K | I | D | L | H | E | A | F | E | P | S | R | L | E | K | T | K | E | S | I | A | K | E | Q | H | L | R | H | P | V | L | V | V | K | T | L | F | G | R | Y | M | V | I | D | G | V | H | R | F | M | S | L | K | A | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | B | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | E | V | I | P | V | Q | V | I | Q | R | T | Q | Y | S | I | G | S | W | H | H | K | I | P | N | G | A | W | C | E | G | L | T | D | E | E | L | L | P | W | T | T | E | V | R | D | E | T | P | F | I | T | M | C | D | Q | Q | T | E | H | Y | L | Y | V | A | D | L | T | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S | B | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | L | D | I | W | K | K | V | V | N | S | Y | S | A | S | C | N | V | E | R | V | P | H | S | A | C | L | C | L | D | S | N | D | I | L | M | K | Y | Q | P | L | Q | I | G | E | I | E | A | V | V | Q | R | G | Q | T | V | P | A | G | V | T | R | F | N | I | A | G | R | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | N | L | Q | V | P | L | H | L | L | K | N | S | N | L | G | N | Q | E | Q | W | H | T | F | L | Q | K | K | I | E | S | M | R | C | Y | T | E | K | I | Y | L | I | E | A | E | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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