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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5tv6A_ | 2.46 | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: 6-carboxyhexanoate--coa ligase; |
Added to library: Thu Feb 9 13:50:47 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | F | S | V | R | X | R | A | Q | K | N | G | K | H | V | S | G | A | E | R | I | V | K | K | E | E | L | E | T | A | V | K | E | L | L | N | R | P | K | E | F | D | F | X | N | V | K | V | E | K | V | K | D | F | E | V | V | K | F | N | L | K | I | S | T | Y | S | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | P | E | E | A | R | E | F | A | V | K | K | L | T | Q | E | G | I | K | E | E | V | A | K | K | A | V | E | I | L | S | K | G | A | N | P | K | G | G | N | X | R | G | A | V | L | X | D | I | E | T | G | E | R | L | E | E | D | K | E | R | G | V | R | T | I | H | F | D | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | B | S | S | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | D | R | K | K | V | T | E | K | L | L | K | E | G | Y | T | L | R | T | V | D | A | L | A | L | T | F | K | N | L | F | C | G | V | V | A | E | L | C | W | S | D | D | P | D | Y | V | T | G | Y | V | S | G | K | E | I | G | Y | V | R | I | T | P | L | K | E | K | G | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | G | G | R | V | Y | F | V | S | R | K | E | L | S | E | I | I | E | C | L | T | Q | K | V | V | L | I | E | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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