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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5tqbB_ | 2.40 | PDB header: ribosomal protein | Chain: B: PDB Molecule: assembly chaperone of ribosomal protein l4 (acl4); |
Added to library: Thu Feb 23 10:31:00 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | I | N | P | K | E | L | L | D | R | A | T | T | L | L | E | E | G | D | I | E | T | A | A | K | V | A | R | T | A | Y | E | H | I | G | E | N | G | R | H | A | G | A | A | L | T | L | L | G | Q | I | H | V | E | L | G | D | I | D | A | A | R | N | Y | Y | A | A | A | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | D | E | D | G | S | L | P | E | E | L | G | G | G | P | E | K | F | L | W | L | A | Q | L | S | E | E | G | G | H | D | S | V | A | W | F | E | R | G | A | T | V | L | R | A | Q | I | Q | S | L | X | D | S | L | E | Q | R | P | L | S | R | G | Q | V | E | A | A | I | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | R | R | R | L | A | E | T | L | C | A | V | V | E | V | Y | X | T | D | L | S | W | E | D | D | A | E | Q | R | C | E | A | L | I | T | E | A | T | X | I | A | P | E | W | P | E | T | W | Q | T | V | A | N | V | R | I | S | Q | E | R | T | E | E | A | R | E | A | L | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | L | G | L | W | T | H | L | P | P | E | D | P | G | V | P | P | F | P | S | R | V | S | L | V | R | L | L | I | E | V | D | X | E | E | E | A | L | E | V | T | E | R | L | I | A | E | D | D | L | S | V | E | V | W | Y | L | G | G | Y | A | R | Y | R | L | G | E | K | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . |
Sequence | E | A | S | G | Q | A | S | E | P | E | A | W | K | D | T | W | R | S | S | R | K | W | L | R | Q | C | L | K | V | F | E | A | E | E | Y | E | D | E | R | L | G | E | H | A | K | E | L | I | A | S | I | I | G | E | L | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T |
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