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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5tpkA_ | 2.00 | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: protocadherin-15; |
Added to library: Sat Oct 28 08:49:28 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | D | N | A | P | V | F | D | P | Y | L | P | R | N | L | S | V | V | E | E | E | A | N | A | F | V | G | Q | V | R | A | T | D | P | D | A | G | I | N | G | Q | V | H | Y | S | L | G | N | F | N | N | L | F | R | I | T | S | N | G | S | I | Y | T | A | V | K | L | N | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | R | D | H | Y | E | L | V | V | V | A | T | D | G | A | V | H | P | R | H | S | T | L | T | L | Y | I | K | V | L | D | I | D | D | N | S | P | V | F | T | N | S | T | Y | T | V | V | V | E | E | N | L | P | A | G | T | S | F | L | Q | I | E | A | K | D | V | D | L | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . |
Sequence | N | V | S | Y | R | I | R | S | P | E | V | K | H | L | F | A | L | H | P | F | T | G | E | L | S | L | L | R | S | L | D | Y | E | A | S | I | T | F | L | A | E | A | F | D | I | Y | G | T | M | P | P | G | I | A | T | V | T | V | I | V | K | D | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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