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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5tkwA_ | 1.35 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: type ii secretion system protein l; |
Added to library: Thu Feb 9 13:11:17 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | K | I | N | A | S | P | Q | A | X | L | I | V | R | L | A | A | A | Q | A | P | L | H | W | Q | L | F | A | P | G | E | P | H | H | E | A | S | G | R | W | P | T | D | D | A | S | P | F | P | A | L | A | E | Q | Y | P | A | W | V | L | I | P | A | S | D | C | A | F | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | L | P | A | G | L | R | K | P | P | L | Q | V | A | P | F | L | L | E | E | Q | L | A | D | D | V | E | A | T | H | F | A | L | L | H | R | Q | Q | A | Q | C | E | I | V | A | V | Q | R | Q | K | X | R | D | W | L | A | R | C | E | S | L | S | L | Q | P | L | A | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | D | V | L | A | L | P | W | Q | P | P | A | W | S | A | V | Q | V | D | E | Q | W | L | I | R | H | Q | P | W | G | G | X | A | A | E | N | V | W | L | T | E | L | L | Q | S | E | A | E | E | H | V | I | D | S | Y | S | P | P | P | A | A | P | G | V | W | R | E | Q | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | Q | T | L | L | T | L | A | A | R | H | P | A | A | Q | K | L | S | L | L | Q | G | E | F | A | V | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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