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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5tj5D_ | 3.90 | PDB header: motor protein | Chain: D: PDB Molecule: v-type proton atpase subunit c'; |
Added to library: Thu Feb 9 18:27:08 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | F | G | F | A | G | C | A | A | A | M | V | L | S | C | L | G | A | A | I | G | T | A | K | S | G | I | G | I | A | G | I | G | T | F | K | P | E | L | I | M | K | S | L | I | P | V | V | M | S | G | I | L | A | I | Y | G | L | V | V | A | V | L | I | A | G | N | L | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | E | D | Y | T | L | F | N | G | F | M | H | L | S | C | G | L | C | V | G | F | A | C | L | S | S | G | Y | A | I | G | M | V | G | D | V | G | V | R | K | Y | M | H | Q | P | R | L | F | V | G | I | V | L | I | L | I | F | S | E | V | L | G | L | Y | G | M | I | V | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | L | N | T | R | G | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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