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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5t5dA_ | 2.50 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: pts system, iib component; |
Added to library: Thu Feb 9 11:31:28 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | I | E | F | V | R | I | D | D | R | L | V | H | G | Q | V | V | T | T | W | L | K | K | Y | D | I | E | Q | V | I | I | V | N | D | R | I | S | E | D | K | T | R | Q | S | I | L | K | I | S | A | P | V | G | L | K | I | V | F | F | S | V | K | R | F | V | E | V | L | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | I | K | K | R | T | M | L | I | Y | T | N | P | K | D | V | Y | D | S | I | E | G | N | L | K | L | E | Y | L | N | V | G | Q | M | S | E | K | V | T | G | G | V | A | L | G | E | E | D | K | Y | Y | F | K | K | I | V | D | K | G | T | R | V | E | I | Q | M | V | P | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | K | V | T | M | L | E | K | F | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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