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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5t57A_ | 1.65 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: semialdehyde dehydrogenase nad-binding protein; |
Added to library: Thu Feb 9 12:33:20 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | E | K | I | A | L | F | G | A | G | G | K | M | G | V | R | L | A | K | N | L | L | K | S | D | Y | R | V | S | H | V | E | V | S | E | V | G | K | K | R | L | K | D | E | L | G | L | E | C | V | S | T | E | A | A | L | D | N | V | D | V | V | I | L | A | V | P | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | G | K | I | A | A | Q | I | A | P | Q | L | R | P | G | T | M | V | M | T | L | D | A | A | A | P | F | A | G | H | L | P | D | R | P | D | L | T | Y | F | V | A | H | P | C | H | P | L | I | F | N | D | E | T | D | P | E | A | R | R | D | Y | F | G | G | G | A | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | S | I | T | S | A | L | M | Q | G | P | E | E | A | F | D | L | G | E | A | V | A | K | V | I | Y | A | P | I | L | R | S | Y | R | L | T | V | D | Q | M | A | L | L | E | P | G | L | S | E | T | I | C | A | T | L | L | Q | V | M | R | E | A | M | D | E | T | V | R | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | P | K | E | A | A | R | D | F | L | L | G | H | M | N | I | L | G | A | V | I | F | N | E | I | P | G | A | F | S | D | A | C | N | K | A | I | E | F | G | K | P | R | L | M | R | D | D | W | I | K | V | F | D | R | E | E | I | A | E | S | I | R | R | I | T | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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