| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5sy7B_ | 4.20 | PDB header: transcription/dna | Chain: B: PDB Molecule: neuronal pas domain-containing protein 3; |
Added to library: Thu Feb 9 15:52:06 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | R | K | E | K | S | R | D | A | A | R | S | R | R | G | K | E | N | F | E | F | Y | E | L | A | K | L | L | P | L | P | A | A | I | T | S | Q | L | D | K | A | S | I | I | R | L | T | I | S | Y | L | K | M | R | D | F | A | N | Q | G | D | I | E | V | F | E | A | H | L | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | I | L | Q | S | L | D | G | F | V | F | A | L | N | Q | E | G | K | F | L | Y | I | S | E | T | V | S | I | Y | L | G | L | S | Q | V | E | L | T | G | S | S | V | F | D | Y | V | H | P | G | D | H | V | E | M | A | E | Q | L | G | M | L | E | R | S | F | F | I | R | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T | S | B | G | G | G | G | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | L | G | Y | K | V | I | H | I | T | G | R | L | R | M | G | L | V | V | V | A | H | A | L | P | H | M | F | V | T | R | V | N | M | D | L | N | I | I | Y | C | E | N | R | I | S | D | Y | M | D | L | T | P | V | D | I | V | G | K | R | C | Y | H | F | I | H | A | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | B | G | G | G | T | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | E | G | I | R | H | S | H | L | D | L | L | N | K | G | Q | C | V | T | K | Y | Y | R | W | M | Q | K | N | G | G | Y | I | W | I | Q | S | S | A | T | I | A | K | N | I | I | W | V | N | Y | L | L | S | N | P | E | Y | K | D | T | P | M | D | I | A | Q | L | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|