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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5of3E_ | 2.91 | PDB header: replication | Chain: E: PDB Molecule: dna primase large subunit pril; |
Added to library: Sat Dec 2 08:14:47 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | D | V | K | K | Y | P | F | I | K | S | L | D | D | E | L | K | K | Y | G | G | G | I | T | L | T | D | L | L | L | N | S | T | T | L | I | D | Q | A | K | D | R | I | Q | K | T | K | S | G | D | E | L | P | H | Y | V | S | Y | N | E | P | V | L | V | F | Y | T | T | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | L | A | I | L | N | D | V | K | L | I | R | R | Y | A | Y | A | E | A | K | Q | F | R | S | L | L | H | T | E | N | E | E | N | L | L | E | I | S | K | L | L | D | L | K | I | N | R | C | D | P | I | K | F | Y | L | E | K | K | R | R | I | I | Q | K | E | F | C | V | H | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | D | Y | L | K | Y | T | K | D | L | K | E | D | W | K | L | S | G | Q | I | L | H | K | G | Y | V | Y | L | D | K | N | Q | L | I | G | L | I | A | E | S | I | K | S | K | I | V | E | M | I | R | P | L | N | L | K | E | I | P | E | K | L | K | S | L | I | E | R | R | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | I | P | P | C | I | E | N | I | L | A | K | E | K | L | N | E | E | E | I | R | T | L | I | T | F | Y | I | D | I | G | K | G | L | S | G | I | V | S | I | M | K | K | Y | N | V | S | N | V | E | D | L | Y | R | K | Y | P | L | Q | L | Y | F | L | S | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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