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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ocpA_ | 1.70 | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: periplasmic binding protein/laci transcriptional regulator; |
Added to library: Sat Aug 4 09:27:02 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | T | V | G | F | S | Q | V | G | S | E | S | G | W | R | T | S | F | S | E | A | V | K | A | E | A | K | Q | R | G | I | D | L | K | F | A | D | A | Q | Q | K | Q | E | N | Q | I | K | A | V | R | S | F | I | A | Q | G | V | D | A | I | I | I | A | P | V | V | E | T | G | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | P | V | L | K | E | A | K | R | A | K | I | P | V | V | I | V | D | R | N | I | K | V | D | D | D | S | L | F | L | T | R | I | A | S | D | F | S | E | E | G | R | K | I | G | Q | W | L | M | D | K | T | Q | G | N | C | D | I | A | E | L | Q | G | T | V | G | A | T | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | D | R | A | A | G | F | N | Q | V | I | A | N | Y | P | N | A | K | I | V | R | S | Q | T | G | E | F | T | R | A | K | G | K | E | V | M | E | G | F | L | K | A | Q | N | G | Q | P | L | C | A | V | W | S | H | N | D | E | M | A | L | G | A | V | Q | A | I | K | E | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | K | P | G | K | D | I | L | I | V | S | V | D | G | V | P | D | Y | F | K | A | M | A | D | G | D | V | N | A | T | V | E | L | S | P | Y | L | G | G | P | A | F | D | A | I | D | A | Y | L | K | G | N | K | D | Q | A | K | L | I | S | T | T | G | D | V | F | T | Q | E | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | B | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | A | A | E | Y | E | K | R | R | Q | Q | A | A | A | L | E | H | H | H | H | H | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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