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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5nxdB_ | 1.90 | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: lim domain kinase 2; |
Added to library: Sat May 27 10:26:41 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | I | H | G | E | V | L | G | K | G | F | F | G | Q | A | I | K | V | T | H | K | A | T | G | K | V | M | V | M | K | E | L | I | R | C | D | E | E | T | Q | K | T | F | L | T | E | V | K | V | M | R | S | L | D | H | P | N | V | L | K | F | I | G | V | L | Y | K | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | N | L | L | T | E | Y | I | E | G | G | T | L | K | D | F | L | R | S | M | D | P | F | P | W | Q | Q | K | V | R | F | A | K | G | I | A | S | G | M | A | Y | L | H | S | M | C | I | I | H | R | D | L | N | S | H | N | C | L | I | K | L | D | K | T | V | V | V | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | G | L | S | R | L | I | V | P | Y | W | M | A | P | E | M | L | N | G | K | S | Y | D | E | T | V | D | I | F | S | F | G | I | V | L | C | E | I | I | G | Q | V | Y | A | D | P | D | C | L | P | R | T | L | D | F | G | L | N | V | K | L | F | W | E | K | F | V | P | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | B | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . |
Sequence | C | P | P | A | F | F | P | L | A | A | I | C | C | R | L | E | P | E | S | R | P | A | F | S | K | L | E | D | S | F | E | A | L | S | L | Y | L | G | E | L | G | I | P | L | P | A | E | L | E | E | L | D | H | T | V | S | M | Q | Y | G | L | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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