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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5nv8A_ | 2.29 | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: ef-p arginine 32 rhamnosyl-transferase; |
Added to library: Sat Oct 7 08:20:57 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | A | T | W | D | I | F | C | S | V | D | N | Y | G | D | I | G | V | T | W | R | L | A | R | Q | L | V | A | E | H | G | L | A | V | R | L | W | V | D | D | L | A | D | A | T | A | A | A | W | L | G | A | F | C | Q | L | P | A | A | Y | V | E | A | M | P | S | N | G | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | V | F | F | F | P | G | F | T | D | K | G | L | L | R | E | G | S | L | L | A | R | R | D | G | F | Q | Q | S | A | E | A | R | R | A | F | L | Q | G | L | G | V | D | L | V | P | G | A | L | L | I | S | L | F | A | Y | E | N | P | Q | L | G | N | W | L | D | A | L | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | D | Q | P | C | H | L | L | V | P | Q | G | R | V | V | A | G | L | S | Q | W | L | G | E | G | P | L | H | V | G | D | V | R | T | R | G | A | L | T | V | Q | V | L | P | F | V | S | Q | D | D | F | D | R | L | L | W | S | C | D | F | N | A | V | R | G | E | D | S | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | A | Q | W | A | G | Q | P | M | L | W | H | I | Y | V | E | K | L | E | A | F | L | A | H | Y | R | C | G | L | S | D | D | A | D | A | A | L | L | G | L | W | R | A | W | N | M | D | F | D | M | G | Q | A | W | R | A | A | R | Q | H | W | P | E | L | Q | Q | H | A | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | W | G | A | R | Q | A | A | Q | P | D | L | A | T | A | L | V | H | F | Y | R | N | S | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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