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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5nufA_ | 1.80 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: malate dehydrogenase 1, cytoplasmic; |
Added to library: Sat Jan 13 08:20:02 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | K | E | P | V | R | V | L | V | T | G | A | A | G | Q | I | G | Y | A | L | V | P | M | I | A | R | G | I | M | L | G | A | D | Q | P | V | I | L | H | M | L | D | I | P | P | A | A | E | A | L | N | G | V | K | M | E | L | I | D | A | A | F | P | L | L | K | G | V | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | D | A | V | E | G | C | T | G | V | N | V | A | V | M | V | G | G | F | P | R | K | E | G | M | E | R | K | D | V | M | S | K | N | V | S | I | Y | K | S | Q | A | A | A | L | E | K | H | A | A | P | N | C | K | V | L | V | V | A | N | P | A | N | T | N | A | L | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | F | A | P | S | I | P | E | K | N | I | S | C | L | T | R | L | D | H | N | R | A | L | G | Q | I | S | E | R | L | S | V | P | V | S | D | V | K | N | V | I | I | W | G | N | H | S | S | S | Q | Y | P | D | V | N | H | A | K | V | Q | T | S | S | G | E | K | P | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | G | G | G | B | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | L | V | K | D | D | A | W | L | D | G | E | F | I | S | T | V | Q | Q | R | G | A | A | I | I | K | A | R | K | L | S | S | A | L | S | A | A | S | S | A | C | D | H | I | R | D | W | V | L | G | T | P | E | G | T | F | V | S | M | G | V | Y | S | D | G | S | Y | S | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | ||||||||
Sequence | S | G | L | I | Y | S | F | P | V | T | C | R | N | G | D | W | S | I | V | Q | G | L | P | I | D | E | V | S | R | K | K | M | D | L | T | A | E | E | L | K | E | E | K | D | L | A | Y | S | C | L | S | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T |
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