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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5nkkB_ | 2.64 | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: protein smg-9; |
Added to library: Sat Apr 22 08:17:56 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | E | S | V | R | F | L | T | D | F | G | E | I | S | D | A | I | S | D | L | L | T | S | S | P | N | F | N | V | I | S | A | I | G | P | Q | G | A | G | K | S | T | L | L | S | M | L | A | G | N | N | S | R | Q | M | Y | R | E | Y | V | F | R | P | V | Q | T | I | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | G | G | G | B | T | T | S | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | Y | I | V | N | H | Q | I | F | L | D | C | Q | P | M | Y | D | D | S | T | A | M | S | D | T | L | R | L | T | A | F | L | L | Y | V | S | H | T | V | L | V | V | S | E | T | H | Y | D | K | V | I | I | D | T | L | R | V | A | E | Q | I | R | P | Y | L | A | I | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | K | L | A | I | D | R | K | T | N | L | V | F | I | K | T | K | A | S | S | I | D | L | A | P | T | V | I | R | E | R | E | E | L | L | R | L | S | F | Q | D | S | R | W | L | K | V | S | Q | E | P | F | K | T | L | I | V | L | E | E | F | D | E | Q | I | A | E | L | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | E | L | Q | K | N | R | E | D | F | T | V | E | T | A | A | M | D | E | K | K | W | L | D | M | C | R | E | V | I | R | D | K | T | L | H | K | T | L | K | E | Y | Q | R | A | M | T | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | T |
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